Małgorzata Krasnodębska-Tomkiel jest doktorem prawa. Związana jest z Urzędem Ochrony Konkurencji i Konsumentów 1998 r. Od 21 czerwca 2007 r. była wiceprezesem nadzorującym prace departamentów: ochrony konkurencji, prawnego i orzecznictwa europejskiego oraz nadzoru rynku. Na stanowisko prezesa powołał ją premier Donald Tusk 4 czerwca 2008 r. Zastąpiła Marka Niechciała, szefującego urzędowi z nadania PiS.
Jest także wykładowcą prawa wspólnotowego oraz antymonopolowego na Uniwersytecie Warszawskim, w Szkole Głównej Handlowej i Krajowej Szkole Administracji Publicznej.