Opłaty, jakie przewoźnicy kolejowi płacą PKP PLK za korzystanie z infrastruktury kolejowej, mają być liczone według nowych zasad. Nowelizacja dostosowuje polskie prawo do wyroku Trybunału Sprawiedliwości Unii Europejskiej, który w maju 2013 r. uznał, że przepisy, według których zarządzająca torami spółka PKP PLK naliczała opłaty za dostęp do torów, były źle sformułowane. W efekcie przewoźnicy płacili więcej, niż by mogli. Nowelizacja zakłada m.in. przekazanie w 2014 r.
PKP PLK 500 mln zł z Funduszu Kolejowego, co ma sfinansować obniżki stawki dostępu do torów średnio o około jedną piątą. Według autorów nowela spowoduje wzrost wydatków publicznych, w tym budżetu państwa, na funkcjonowanie infrastruktury kolejowej o około 900 mln zł rocznie.