24 listopada 2003 roku Naczelny Sąd Administracyjny w Warszawie uchylił swoim wyrokiem decyzje dotyczące Grupa Onet S.A: Izby Skarbowej oraz Inspektora Kontroli Skarbowej w Urzędzie Kontroli Skarbowej w Krakowie, w których to decyzjach dokonano wymiaru podatku VAT za lata 1998-1999 w łącznej kwocie ok. 15,6 mln zł (wraz z odsetkami za zwłokę).
Wyrok jest prawomocny i nie podlega zaskarżeniu w zwykłym toku instancji. W związku z powyższym wyrokiem Spółka spodziewa się otrzymać zwrot nadpłaconego podatku i odsetek w wysokości około 16,7 mln zł (w tym opłata prolongacyjna, dotycząca rozłożenia na raty płatności wynikających z orzeczonych przez organy skarbowe decyzji), powiększonych o odsetki. Po dokonaniu odpowiednich rozliczeń kwoty te zostaną przekazane Optimus S.A. i BRE Bank S.A., ponieważ w wyniku realizacji umowy z dnia 26 lutego 2002 r., zawartej pomiędzy spółkami GRUPA ONET.PL S.A. a Optimus S.A. oraz późniejszych uzgodnień, kwoty przekazywane na pokrycie orzeczonych uprzednio zobowiązań podatkowych były finansowane ze środków udostępnionych przez Optimus S.A. oraz BRE Bank S.A.
Komentarz BM BPH PBK: wyrok NSA jest bardzo dobrą informacją dla Optimusa. Postępowanie organów skarbowych oraz przed NSA dotyczyło spółki Grupa Onet S.A., która poprzednio pod marką Optimus prowadziła działalność w zakresie montażu komputerów. Optimus S.A. spółka powstała po podziale dawnego Optimusa przejęła część technologiczną prowadzonej działalności spółki dzielonej i na podstawie umowy z lutego 2002 roku przejął na siebie wszystkie zobowiązania podatkowe Grupy Onet.pl, powstałe przed podziałem. Wyrok NSA dotyczący podatku VAT za lata 1998-1999. będzie mieć dalsze konsekwencje dla spółki. Izba Skarbowa w Krakowie zawiesiła bowiem postępowanie odwoławcze od decyzji Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej dotyczących podatku VAT za 2000 r. do czasu rozstrzygnięcia sprawy przez NSA. Spółce groziła konieczność zapłaty ok. 17 mln zaległości podatkowych za rok 2000. Wyrok NSA praktycznie przesądza również o decyzji Izby Skarbowej. Spółka będzie mogła rozwiązać rezerwę utworzoną w związku z decyzjami organów skarbowych w wysokości ok. 7 mln zł. Taki będzie wpływ wyroku na wynik brutto spółki w IV kwartale. Sam zwrot środków pieniężnych, ani oczekiwane uchylenie przez Izbę Skarbową decyzji dotyczących podatku za 2000r. nie wpłyną na wyniki spółki.