19 marca 2013 r. Rada Ministrów podjęła uchwałę w sprawie zatwierdzenia „Programu rzeczowo-finansowego wykorzystania środków Funduszu Kolejowego w 2013 r.” Fundusz na ten rok będzie dysponował około 1,32 mld zł, z czego ma wydać około 1,23 mld zł. Ponad 265,27 mln zł pochłonie przygotowanie oraz budowa i przebudowa linii kolejowych realizowana przez PKP PLK.
Na projekty realizowane przez PKP SKM w Trójmieście przeznaczono 12 mln zł. Na realizację zadań związanych z remontami i utrzymaniem linii kolejowych przewidziano 259 mln zł, a niemal 136,6 mln zł na finansowanie lub współfinansowanie przez samorządy województw zakupu, modernizacji i napraw pojazdów kolejowych przeznaczonych do przewozów pasażerskich.
Jednak lwią część wydatków— 500 mln zł — pochłonie sfinansowanie nabycia od PKP przez Skarb Państwa akcji PKP PLK. 60 mln zł zostanie przeznaczonych na bieżące wydatki PKP PLK związane z zarządzaniem kolejową infrastrukturą.
Głównym źródłem zasilającym Fundusz Kolejowy są pieniądze pochodzące z 20 proc. wpływów z opłaty paliwowej, pobieranej od wprowadzanych na rynek krajowy paliw silnikowych i gazu. MIB