Krajowa Izba Odwoławcza (KIO) nakazała Ministerstwu Finansów unieważnienie wyboru Sygnity, które miało wykonać i przez osiem lat utrzymywać system e-podatki. Zastrzeżenia KIO dotyczyły głównie zaakceptowania przez ministerstwo poufności zbyt wielu dokumentów związanych z postępowaniem. Sygnity ma ujawnić koncepcję architektury oraz specyfikację proponowanego systemu, Asseco Poland — sposób kalkulacji ceny, a Comarch i SKG — polisy ubezpieczeniowe i gwarancje bankowe.

— Jawność jest generalną zasadą postępowań publicznych. Wszelkie odstępstwa powinny mieć charakter wyjątkowy. Oferty powinny być jawne nie tylko dla pozostałych wykonawców, ale dla każdego zainteresowanego. Zwłaszcza jeśli chodzi o system tak kluczowy dla funkcjonowania państwa — uzasadniał orzeczenie Paweł Trojan, przewodniczący składu orzekającego.
KIO odrzuciła zarzuty dotyczące przyznania Sygnity Asseco i Comarchowi zbyt dużej liczby punktów. Sygnity, mimo że pierwotnie zwyciężyło, jest dalej od zdobycia kontraktu niż konkurenci. KIO zgodziła się z zarzutem i poddała w wątpliwość gwarancję ubezpieczeniową giełdowej spółki. Zastrzegła, że ministerstwo musi wezwać Sygnity do uzupełnienia dokumentów, zanim podejmie decyzję o wykluczeniu go z postępowania. KIO odrzuciła natomiast skargę SMT Software, której oferta została zdyskwalifikowana ze względu na gwarancję wadialną.
— Wniesienie wadium, które nie spełnia wszystkich kryteriów, obliguje zamawiającego do wykluczenia wykonawcy z postępowania — mówił Paweł Trojan.
W przetargu złożono pięć ofert wartości 215 do 267 mln zł. Jest on jednak tak skonstruowany, że wykonawca systemu w praktyce może liczyć nawet na 100 mln zł więcej. Ministerstwo zastrzegło sobie możliwość udzielenia zwycięzcy zamówień uzupełniających. Przy zmienności przepisów podatkowych są one pewne. Odwołań do KIO nie składała bielska spółka SKG, która zaproponowała najniższą cenę. Zajęła ona dopiero czwarte miejsce w punktacji, znacznie ustępując Sygnity, Asseco i najdroższemu Comarchowi. Powód? Za cenę można było otrzymać tylko 40 proc. punktów. Reszta była dzielona po równo między koncepcję architektury systemu i jej wykonalność. Koncepcja architektury to nic innego jak miejsce w rankingu firmy analitycznej Gartner. Tymczasem nie klasyfikuje ona polskiego oprogramowania. Sygnity zaproponowało oprogramowanie firmy Fast Enterprises, Asseco i Comarch — różne konfiguracje aplikacji Oracle.