Zapewnienie pracownikom pakietów medycznych przez pracodawców nie jest opodatkowane. W wyniku trwających prac nad nowelizacją ustawy o VAT (planowana zmiana przepisów dotyczących nieodpłatnego świadczenia usług), może jednak dojść do opodatkowania pakietów medycznych na rzecz pracowników.
Niezależnie od tego, od 1 stycznia 2011 r. (w związku ze zmianą zakresu zwolnienia dla usług medycznych) wątpliwości budzi kwestia opodatkowania pakietów medycznych dla członków rodzin pracowników. Kierując się aktualnym brzmieniem przepisów należałoby uznać, że przy obciążaniu pracowników kosztami pakietów medycznych w części przypadającej na członków ich rodzin powinno się stosować podstawową stawkę VAT.
Ministerstwo Finansów deklaruje jednak, że pakiety medyczne przekazywane pracownikom i członkom ich rodzin nie będą opodatkowane. Te zapewnienia powinny jednak znaleźć odzwierciedlenie w toku trwających prac nad nowelizacją przepisów o VAT. Do czasu ostatecznego rozstrzygnięcia tych kwestii, mogą one budzić spory w praktyce.
Sytuacja w zakresie opodatkowania ubezpieczeń zdrowotnych finansowanych pracownikom przez pracodawców nie uległa natomiast zmianie. W świetle aktualnych przepisów tego typu usługi powinny być zwolnienione z VAT.
