Rok 2006 grupa PKP zamknęła stratą 100 mln zł. Najgorzej sprawowała się spółka PKP Przewozy Regionalne, która straciła 227 mln zł.
W ubiegłym roku przychody grupy PKP wyniosły 11,4 mld zł i były większe o 400 mln zł niż rok wcześniej. Mimo to firma zanotowała stratę na poziomie 100 mln zł (najniższą w historii). Najlepiej z rynkiem poradziła sobie spółka Linia Hutnicza Szerokotorowa, która zarobiła 65 mln zł. PKP Cargo zdołały wypracować zysk na poziomie 53 mln zł, a PKP Intercity zarobiło 30 mln zł. Najsłabiej, co nie zaskakuje, wypadła spółka Przewozy Regionalne, która rok zamknęła stratą 227 mln zł, mimo to wynik jest lepszy od poprzedniego o 420 mln zł.
W ubiegłym roku grupa zmniejszyła koszty o blisko 300 mln zł i zredukowała zatrudnienie o tysiąc etatów. Ponadto zwiększyła wydatki inwestycyjne — w ciągu ostatniego roku zainwestowała 1,92 mld zł, z czego 36 proc. pochodziło z budżetu państwa, 27 proc. z Unii Europejskiej, a resztę stanowiły środki własne. Ponad połowę pieniędzy firma przeznaczyła na modernizację dróg kolejowych, a jedną piątą na modernizację i zakup nowego taboru.
Firma podliczyła także przewiezionych pasażerów i towary. Z usług PKP skorzystało 219 mln osób — to pierwszy wzrost od 17 lat. Wzrost przewozów odnotowały także spółki towarowe: PKP Cargo i PKP Linia Hutnicza Szerokotorowa, które w 2006 r. przetransportowały 156,5 mln ton ładunków — o 6,6 mln ton więcej niż rok wcześniej.