Obecnie resort szacuje koszt, w tym usunięcia skażenia i odszkodowań, na 21,5 bln JPY (188,4 mld USD). W 2013 roku szacowało go na 11 bln JPY.
Szacowany wzrost odszkodowań zwiększono z 5,4 bln JPY do 7,9 bln JPY. Aż 12 bln JPY ma kosztować usunięcie skażenia i rozbiórka instalacji elektrowni, co ma trwać następne cztery dekady.